Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col2a1P28481 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms