Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Hoxd10P28359 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd10P28359 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms