Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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