Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra3P26049 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms