Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk11bP24788 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms