Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZfaP23607 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms