Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PparaP23204 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PparaP23204 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PparaP23204 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PparaP23204 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PparaP23204 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms