Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Eif3aP23116 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms