Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a2P20490 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms