Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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