Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SagP20443 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SagP20443 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SagP20443 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SagP20443 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms