Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Esr1P19785 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms