Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ms4a1P19437 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ms4a1P19437 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms