Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rpl13aP19253 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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