Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NefhP19246 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NefhP19246 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NefhP19246 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NefhP19246 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NefhP19246 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NefhP19246 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms