Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18530 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18530 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18530 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms