Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18529 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18529 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18529 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms