Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P18526 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18526 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18526 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18526 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18526 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P18526 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18526 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18526 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18526 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18526 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18526 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18526 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18526 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18526 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms