Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtpraP18052 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms