Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hoxb1P17919 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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