Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcnaP17918 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms