Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gata1P17679 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms