Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa-rs1P17533 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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