Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tgfb3P17125 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms