Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmga1P17095 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms