Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms