Protein–RNA interactions for Protein: P14685

Psmd3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd3P14685 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd3P14685 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms