Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MdkP12025 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MdkP12025 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MdkP12025 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MdkP12025 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MdkP12025 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MdkP12025 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MdkP12025 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms