Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
OtcP11725 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OtcP11725 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms