Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DmdP11531 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DmdP11531 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DmdP11531 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DmdP11531 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DmdP11531 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DmdP11531 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DmdP11531 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms