Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcea1P10711 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcea1P10711 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcea1P10711 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea1P10711 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea1P10711 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcea1P10711 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms