Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl2P10148 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl2P10148 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms