Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sbk3P0C5K0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sbk3P0C5K0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms