Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LtaP09225 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LtaP09225 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtaP09225 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtaP09225 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtaP09225 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtaP09225 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LtaP09225 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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