Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxb5P09079 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxb5P09079 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms