Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms