Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd4P06332 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms