Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P06323 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P06323 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P06323 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P06323 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P06323 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P06323 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P06323 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P06323 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P06323 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P06323 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P06323 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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