Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
JunP05627 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
JunP05627 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JunP05627 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JunP05627 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JunP05627 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
JunP05627 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JunP05627 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JunP05627 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
JunP05627 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms