Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PdgfrbP05622 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PdgfrbP05622 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PdgfrbP05622 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfrbP05622 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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