Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-Eb1P04230 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms