Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01878 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01878 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01878 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01878 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01878 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01878 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms