Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01852 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01852 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01852 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01852 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01852 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01852 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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