Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01810 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01810 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01810 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01810 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01810 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms