Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01747 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01747 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01747 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01747 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01747 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01747 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01747 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms