Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01673 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01673 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01673 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01673 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01673 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01673 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01673 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01673 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01673 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01673 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01673 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01673 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01673 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms