Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01669 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01669 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01669 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01669 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01669 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms