Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01649 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01649 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01649 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01649 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01649 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01649 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01649 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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P01649 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01649 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01649 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01649 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P01649 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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