Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms