Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3pxd2aO89032 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms